請問什麼是5.8S RNA?它可以用來做什麼?

Question

如題

請問什麼是「5.8S RNA」?

有些什麼功用?

用來做什麼?

我所謂的「做什麼」，是指它如何用來作為物種親源關係分類的依據

Answer 1

5.8S RNA是真核細胞核糖體中大單位的成分之一。(原核細胞沒有喔。)
在演化上，它被用來判斷真核物種親緣關係的分類依據，愈接近的物種，
其蛋白質或核酸的序列 (一級結構) 就愈相近。
或許你想問，細胞內的蛋白質或核酸那麼多種，為何偏要挑 5.8S RNA呢？
同學，當你廣泛比較某一未知物種時，總要挑一個確定該細胞內一定會有的分子吧。每個細胞都要合成蛋白質，所以一定具有核糖體，因此核糖體 RNA (rRNA) 就被普遍拿來作為比較演化關係的分子了。
by Dr. Chen

Answer 2

5.8S..這裡的S是指離心沉降係數..就是將RNA以梯度離心的方式來進行..5.8是指它的沉降係數是5.8
由於RNA是單股的..有些PAPER的資料是使用它來做物種親源關係分類的依據
要進行物種鑑定時..要先把目標的RNA抽出再做長cDNA(互補DNA)
再將目標的cDNA(互補DNA)以及MARKER(5.8RNA)一起送入核酸定序儀中..來比較兩者的接近程度..再將DATA送入基因庫中去進行妳的目標物種是甚麼(以基因庫的數據跟你的目標物種的接近程度是多少)..假如你的目標跟基因庫比對程度是90%..那麼就表示這個物種可能已經被別人找出了..若是這個物種跟別人所發現的
生理及型態不太一樣..那麼要恭喜妳..你可能已經發現新的品種了
我的回達到此...

Answer 3

5.8S rRNA 是細胞中核糖體(ribosome)的組成RNA
所以稱 rRNA 即ribosomal RNA
核糖體是細胞中生成蛋白質的工廠
5.8S rRNA 功用不意外地就牽涉在負責細胞中蛋白質合成的一個稱為"轉譯"的過程中
用來做什麼? 我們在實驗室中檢視5.8S rRNA 可有專業的用處這裡不多說
日常生活或保健醫藥上應該不能用來做什麼

Answer 4

RNA的合成 　原核生物 RNA聚合酶的各種亞基，轉錄起始，轉錄延伸過程中的化學反應，原核生物的轉錄終止的兩種形式；　　真核生物 RNA聚合酶的特點，轉錄起始、延伸及終止。真核與原核生物RNA合成比較。　　真核生物 mRNA轉錄後5ˊ端加帽；3ˊ端加尾及mRNA鏈進行剪接修飾，tRNA及rRNA的轉錄後加工過程，內含子的剪接方式。核酶的概念、應用。　轉錄作用及其特點　　 轉錄作用是DNA指導的RNA合成作用。反應是以DNA爲模板，在RNA聚合酶催化下，以四種三磷酸核苷（NTP）即ATP、GTP、CTP及UTP爲原料，各種核苷酸之間的3′、5′磷酸二酯鍵相連進行的聚合反應。合成反應的方向爲5′→3′。反應體系中還有Mg 2+、Mn 2+等參與，反應中不需要引物參與。堿基互補原則爲A-U、G-C，在RNA中U替代T與A配對。 　　 DNA分子多爲雙股鏈的分子，在轉錄作用進行時，DNA雙鏈中只有一條鏈作爲模板，指導合成與其互補的RNA。此DNA鏈稱爲模板鍵，另一條鏈稱爲編碼鏈。編碼鏈的序列與轉錄本RNA的序列基本相同，只是編碼鏈上的T在相應轉錄本上爲U，由於轉錄本RNA編碼基因表達的蛋白質産物，DNA的這條鏈也由此命名爲編碼鏈。編碼鏈又稱爲有義鏈；模板鏈又稱爲反義鏈。　　 在多基因的雙鏈DNA分子中，每個基因的模板不是全在同一條鏈上，也就是在雙鏈DNA分子中的一條鏈，對於某基因是有義鏈，但對另一個基因則可能是反義鏈。　　 轉錄作用開始時，RNA聚合酶結合于基因的特定部位，在此附近DNA雙鍵打開約17個堿基對，形成一轉錄泡，進行核苷酸的聚合反應。隨著RNA聚合酶沿著DNA模板鏈向5′末端的方向移動，核苷酸的聚合反應繼續進行。　　原核生物 RNA聚合酶的幾個特點：①聚合速度比DNA複製的聚合反應速率要慢；②缺乏3′→5′外切酶活性，無校對功能，RNA合成的錯誤率比DNA複製高很多；③原核生物RNA聚合酶的活性可以被利福黴素及利福平所抑制，這是由於它們可以和RNA聚合酶的β亞基相結合，而影響到酶的作用。　　 2.真核生物的RNA聚合酶　　 真核生物中已發現有四種RNA聚合酶，分別稱RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Mt。　　 RNA聚合酶Ⅱ轉錄生成hnRNA和mRNA，是真核生物中最活躍的RNA聚合酶。　　 RNA聚合酶Ⅲ轉錄的産物都是小分子量的RNA，tRNA的，5SrRNA的和snRNA。　　 RNA聚合酶Ⅰ轉錄産物是45SrRNA，生成除5SrRNA外的各種rRNA。　　下面小結真核生物的 RNA聚合酶，見表11-1。　　表 11-1　　　Ⅰ　　Ⅱ　　Ⅲ　　 Mt　　定位　　轉錄産物　　核仁　　 5.8S，18S，28SrRNA前體　　核質　　 mRNA前體　　 U1、U2、U4、U5　　 SnRNA前體　　核質　　 tRNA前體　　 5SrRNA前體　　 U6SnRNA前體　　線粒體　　線粒體 RNAS　　對利福平的敏感性利福黴素　　不敏感 (-)　　敏感 (+)　　 (-)　　 (+)　　 (-)　　 (+)　　 (+)　　　　 在DNA分子上還有一段識別部位，是RNA聚合酶的σ因數識別DNA分子的部位。識別部位約有6個堿基對，其中心位於上游-35bp處。所以稱爲-35區，其共有序列5′-TTGACA-3′。其示意圖見圖11-1。　　 　　（ 2）真核生物的啓動子。　　 一個真核基因按功能可分爲兩部分，即調節區和結構基因。結構基因的DNA序列指導RNA轉錄；如果該DNA序列轉錄産物爲mRNA，則最終翻譯爲蛋白質。調節區由兩類元件組成，一類元件決定基因的基礎表達，又稱爲啓動子；另一類元件決定組織特異性表達或對外環境及刺激應答；兩者共同調節表達。　　 RNA聚合酶Ⅱ識別的啓動子與原核生物的啓動子相似，也具有兩個高度保守的共有序列。其一是在－25附近的一段AT富集序列，其共有序列是TATAA，稱爲TATA盒。TATA盒與原核的Pribonow盒相似，是轉錄因數與DNA分子結合的部位。其二是在多數啓動子中，-70附近共有序列CAAT區，稱爲CAAT盒。除以上兩個區域外，有些啓動子上游中含有GC盒，此GC盒與CAAT盒多位於-40～110之間，它們可影響轉錄起始的頻率。另外，有少量基因缺乏TATA盒，而由起始序列（Inr）與RNA聚合酶Ⅱ直接作用啓動基礎轉錄的開始。啓動子決定了被轉錄基因的啓動頻率與精確性，同時啓動子在DNA序列中的位置和方向是嚴格固定的，是由5′到3′方向。其示意圖見圖11-2。　　 　　增強子：增強子是長約 100～200bp的序列，它們與啓動子不同，可以位於轉錄起始位點的上游，也可位於其下游。有些增強子和靜息子在DNA序列中的方向是嚴格由5′到3′方向排列，而另外一些則是自3′向5′方向排列。增強子和靜息於與其他調節元件的DNA序列是互相重疊的。　　增強子具有增加啓動子的作用，與啓動子都可視爲基因表達調控中的順式作用元件，可與轉錄因數和 RNA聚合酶結合，啓動並調節基因轉錄。　　 RNA聚合酶Ⅰ催化轉錄作用生成的18S、5．8S及 28SrRNA前體，它所識別的啓動子與RNA聚合酶Ⅱ所識的啓動子相比，有較大的差異。　　 RNA聚合酶Ⅲ催化高度保守的 tRNA、5S rRNA及一些小核RNA。它識別的啓動子比較特殊，啓動子不位於編碼基因的上游，而在編碼基因的轉錄區內。