Qual é o genoma da bactéria ingestora de petróleo?

Question

"Não aceitamos respostas paralelas"
Cientistas alemães descobriram uma bactéria no fundo do oceano que come petróleo, falta descobrir o genoma dessa bactéria, alguém aqui se habilita em desvendar esse mistério e dar um salto no campo científico.
Site: www.nature.com/biotechinology-agência FAPESP

Answer 1

Vc vai encontrar no link abaixo o site do banco norte americano de genes (na verdade é mundial)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=genome&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=19683

Só uma coisa: O genoma dessa bactéria contem 2806 genes e vc vai encontrar a sequencias de aminoacidos que ela codifica (letras em maiusculo após a palavra "translation" como AWFGHHR cada letra é um aminoácido formado por três bases nitrogenadas que constitui o genoma)
Para vc saber essa sequencia (a união delas corresponde ao genoma) que deve dar cerca de 312014000000 letras variando entre "a, t, c, g" para cada base nitrogenada.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=nucleotide&val=110645972

Exemplo de um unico gene
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=110645972&itemID=4665&view=gbwithparts

sequencia de bases:
1 gtgtctgaag agctctggca acgctgtttg acgcggctgg aagatgagtt gccgtcgcag
61 cagttcaata tgtggatacg gccgcttcaa gttgctgcgt ctgcagatgg tgcggagcta
121 acattgtttg cccctaaccg gtttgtggtg gattgggttc gtgacaagta cctagatcgc
181 attagcgagg ttctagggga gatgcagtca ggcccccttc cccaattgcg tttggaggta
241 gggtctaccc gtgccagcac gcctgcagca tcgtacttca atggttcctc ctcctcctct
301 agtaatgggc cgataacgac gcctgccgcg gctccagcgc cccgtcagcc tgagtctgat
361 agccgaccgc aacccacttc gttgggtgga gctcgtaagc accgcagcaa ccttaataca
421 ggctttactt tctcaacctt cgttgagggt aaatccaatc gtatggcagc ggcggcagcg
481 cagcaggtag ccgaaaaccc ggccagtcat ggctataacc ctttgctttt gtatggtggt
541 gtggggctgg gtaaaactca cctgatgcat gcggtcggca atgagttgtt gcgacgcaac
601 cccaatgcca aggtggtcta tctgcacagt gaacggtttg tagcagatat gatttctgcc
661 ttacgtaaca agaccattaa cgagtttaag cggttttatc gttctgtgga tgctctgctg
721 attgatgata ttcaattttt tgcaggaaaa gagcagtccc aggaggagtt ttttcacacc
781 ttcaatgcgt tactggaaaa tgggcaacag atcattctca cctgcgacaa gtttcctaaa
841 gaggtggatg gcctagagga gcgtctgaag agccgttttg gttgggggtt gtctcagccg
901 atggagccgc cggaattgga aacgcgagtg gcgattctta agaaaaaagc cgaagaagcc
961 aaggtggatc tgccgaatga tgcggccttc tttattgccc agcggattcg ttcaaacgtg
1021 cgggagctag aaggcgcatt gcgtcgggtg attgctcacg ttcgctttac cggtgcgcag
1081 attgatatcg gcctgatcaa ggaagcgctg aaggatttga ttgcactgca ggcgcgacag
1141 atcagtattg ataatattca gcgcatcgta gccgaatact acaaaattaa gattaatgat
1201 cttttgtctc cacgacgcac acgttccgtg gcgcggcccc ggcaagttgc tatggcgttg
1261 tcgaaagagt tgaccagcca cagcttgccg gaaattggtg agaattttgg tggccgggat
1321 cacactacgg tactgcacgc ctgtcgcaaa gtactggagt tgcgggaatc caatccggaa
1381 attgaagaag attatctgaa tctgttacgg acattgacgt cctaa

Answer 2

hehe, eu tenho um sequenciador aqui debaixo do meu travesseiro, e te empresto se vc quiser passar dias escutando o barulhinho insuportável e esperar as sequencias de aminoácidos específicas dos éxos desta bactéria. está as ordens.
Melhor do que procurar no gene bank acima!

Answer 3

O petróleo bruto, liberado naturalmente das rochas nos fundos dos oceanos, não chega a causar impactos negativos sobre a biota marinha. Muito pelo contrário. Em condições de equilíbrio, ele até serve de alimento para a bactéria "Alcanivorax Borkumensis", que sobrevive única e exclusivamente graças à ingestão do mineral.

Entender como trabalham essas biodigestoras de petróleo – descobertas por pesquisadores do Centro Helmoltz de Pesquisas em Infecções, na Alemanha –, do ponto de vista bioquímico, passou a ser uma pergunta científica relevante. Se as respostas ainda não estão completas, um artigo publicado na edição atual da revista Nature Biotechnology mostra que um avanço significativo foi obtido.